SP6体外转录试剂盒说明书

发布时间:2017/5/11 21:40:00

本试剂盒是基于SP6 RNA聚合酶的RNA体外转录试剂盒,它利用含有SP6启动子的模版DNA,以NTP为底物,从SP6启动子下游开始合成与模版DNA中一条链互补的RNA,简单快速获得大量的RNA分子。本产品具有下列特点:

1. 即开即用,用户只需提供含SP6启动子的DNA模板即可以进行体外转录实验,不需要单独准备每一个成份。

2. 单溶液预配液,减少加样次数,避免了操作误差,增加了可重复性。

3. 模版DNA可以是线性化的质粒DNA,也可以是PCR扩增产物。

4. 可以合成的RNA的长度在20nt到2000 nt之间。

5. 产品配方经过精心优化,每ug DNA模版可以合成2-6 ug RNA。

得到的RNA可以用于RNA 结构研究、核酶生物化学、体外翻译、RNA-蛋白质相互作用、反义技术、SELEX 技术和 RNA 干扰(RNAi)等实验。

低温运输,-20℃保存, 有效期一年。

使用方法:

一、制备DNA模板

PCR片段和质粒DNA都可以用作体外转录的模板,但是必须注意以下几点。一是必须使用线性化的DNA。如果是质粒DNA,则必须先用适当的限制性内切酶切成线状。二是需要转录的DNA序列的上游必须有SP6启动子。如果模板是PCR产物,则可以在设计引物时将SP6启动子序列(5’ATT TAG GTG ACA CTA TAG AGN G 3’)加上,转录其实是从3端G AGN G中的个G开始。如果是将DNA片段克隆到载体上,则需要选择有SP6启动子的载体,并且克隆位点必须位于SP6启动子下游。三是需要转录的DNA序列的下游端不要是3’突出。如果是3’突出(如选择了Pst I来线性化质粒),则用T4 DNA聚合酶修平。四是必须保证DNA模板中没有RNase。由于提取质粒DNA的过程中一般要使用大量的RNase A,因此质粒DNA一般都有严重的RNase A污染,所以在用作模板前,采取胶回收得方法回收质粒DNA。并且加入少量总RNA一起保温,然后电泳检测RNA是否被降解,以此判断纯化的DNA模板是否有残留RNase A。

二、体外转录反应

1. 在一个RNase-free 的塑料离心管中,在室温下(不是在4℃下)按次序加入下列成分

注:此为20 uL反应体系的用量,对其他反应体系,各成分的用量可以按比例增减。如果需要标记RNA探针,则需要订购NTP分开的试剂盒。如果需要得到加帽RNA,则需要加入自备的加帽修饰核苷酸(本公司有各种加帽修饰核苷酸)。

2. 37℃保温1-2小时。注意:延长保温时间并不能提高产量。

3. 70℃加热10分钟灭活SP6 RNA聚合酶。

4. 取1-3uL电泳检测转录效果。一般1 ug DNA可以合成 5-10 ug的RNA。

5. 得到的RNA可以放-80℃保存。

注:若需进一步去除DNA模板,可参考下列操作步骤,但所用试剂需另行购买,本试剂盒不提供。

1. 在体外转录体系中加入3-5 U自备的 RNase-free DNase(BTN90903;3-5 U/uL)。

2. 37℃保温15-30分钟。

3. 补水到100 uL。

4. 用等体积(100 uL)的Tris饱和酚-氯仿抽提去除残留的DNase和RNA聚合酶。

5. 在上清中加200 uL自备的微量核酸沉淀剂(CAT#50903;用前需要摇晃混匀),振荡后15000 rpm离心3-5分钟,弃上清。

6. 加入1 mL 75%乙醇,震荡10秒后15000 rpm离心3-5分钟,弃上清。

7. 短暂离心数秒,用枪头吸弃上清。

8. 晾干半分钟,所得沉淀即去除DNA模板后的RNA。可溶于RNase-free水中后立即使用或放-80℃长期保存。