氢气发生器主要由电解池、开关电源、液路压力自控、净化、流量显示等系统组成。氢气的纯净度、流量和压力对色谱仪的正常运行影响很大，因此纯水氢气发生器的故障应及时排除。以下是氢气发生器在生产中常见故障和排除方法。
　　一、氢气发生器产氢达不到预定的压力，即仪器显示量超出实际使用量较大
　　故障原因：气路系统漏气、过滤器或过滤器上盖没有拧紧、氢气电解池反漏。
　　检查方法：用检漏液检测各气路连接处。
　　排除方法：更换漏气元件、拧紧漏气点、联系厂价更换电解池。
　　二、氢气发生器产氢超过预定的压力
　　故障原因：自动跟踪装置挡光板错位或脱落、光电耦合损坏。
　　检查方法：目测、用万用表测量电路。
　　排除方法：前面板上的压力达到0.3兆帕时关闭电源，把挡光板安装在合理的位置上，打开电源开关轻轻敲紧挡光板即可、更换损坏的光电耦合元件。
　　三、氢气发生器不能启动：故障原因有电路没有接通、氢气开关电源损坏、在压力为0空载运行时电解池烧坏
　　检查方法：检查电路、用万用表测量电解池的电压是否在2.3V左右。
　　排除方法：修理电源、更换损坏的氢气开关电源、更换电解池。
　　氢气发生器出现故障时，要及时解决，以免影响仪器的正常工作。