在免疫学的世界中，抗原的选择是至关重要的。近年来，许多研究者提出了各种不同的抗原类型以供选择，其中最引人注目的两种是蛋白抗原和多肽抗原。这两种抗原各有其独特的优势和特点，那么，如何在这两者之间做出选择呢？本文将为您详细解析两者的差异以及应用场景，帮助您在免疫学研究中做出最佳的选择。

①为什么选择蛋白抗原免疫？

您需要一种适用于多种应用的抗体

您的目标蛋白与其他蛋白的序列相似性低，易于表达和纯化，且无毒

适用于以下应用：

Western Blot、ELISA、IP/ChIP、IHC……

②为什么选择多肽抗原免疫？

您的预期抗体应用仅包括WB，ELISA或翻译后修饰检测。

您的目标蛋白与其他蛋白具有高度的序列相似性，很难或不可能表达和纯化。

适用于以下应用：

Western Blot、ELISA、PTM Detection

多肽抗原是基于天然靶蛋白的序列精心选择的短氨基酸序列。 当目标蛋白的获取受限时，多肽是一种合适的解决方案。 它们也是检测靶蛋白翻译后修饰（PTM）位点的理想抗原，因为它们限制了潜在表位的数量。 虽然潜在表位少对于大多数抗体项目和应用来说是缺点，但是当产生PTM抗体时，有限数量的表位使得发现仅针对PTM位点的反应性抗体更易。

多肽抗原的局限性：

多肽抗原由于其价格低和周期短而具有吸引力，但更重要的是要考虑它的局限性。蛋白质抗原能够诱导针对构象表位的抗体，而针对肽抗原的抗体只能识别线性表位。尽管多肽产生的抗体可以在其他应用中起作用。但多肽抗原的价值主要体现在翻译后修饰检测抗体的制备。例如，抗多肽抗体可以应用于Western blots和ELISA。然而，线性化蛋白必须包括用于免疫的固有线性多肽抗原的表位，以确保阳性结果。