巴氏消毒机的工作过程：水温和奶温设置好后，水温超过设置温度循环水泵循环杀菌层进冷水降低温度，牛奶杀菌机工作时水温过低循环水泵进热水，巴氏消毒机提高水温，使水温始终保持在设定温度。奶罐上方有搅拌装置，通过搅拌装置搅拌奶使奶受热均匀。

巴氏消毒机可根据客户要求订制，巴氏消毒机杀菌箱体、冷却箱体长度与宽度可任意选定。温度可任意设定、自动控制、保持恒定温度、自动记录；采用强制驱动、缩短杀菌时间、能使罐头内温度均匀、巴氏消毒机保证杀菌质量。

巴氏消毒机水循环罐分上下两层，上层冷水下层热水，通过制冷压缩机制冷，水的循环通过循环水泵进出水。奶罐分为三层，外层是保温层，中间是热水杀菌层，巴氏消毒机里层是奶。