1.清理：每次实验做完之后，必须立即检查腔体内有无水雾凝结、误留于其中的化学试剂或其它物体。如有，务必清理干净。腔体内壁和炉门均应用微湿软布清洁，然后用干软布拭干。不可使用粗糙、磨损性的洗剂或物品擦洗。微波反应器外壳应用微湿软布清油，注意不要让任何液体由炉顶流人炉体。控制面板必须用干软布抹擦，擦时请将炉门打开，以防止不小心启动微波炉。擦完之后请按清除键以消除显示窗上的显示。
2．清洗：玻璃转盘、转环和聚四氟乙烯盘架可用热肥皂水浸洗，清水冲狰后拭干备用。它们如肮脏不仅容易产生噪音，而且在实验中同时吸收微波能，干扰化学反庇。
3．风扇：机内风扇经改装保持连续运转状态以利炉体降温、排除残留气体和电路除湿，潮湿季节请注意经常通电令风机工作帮助防潮。
4．除湿：二作结束后立即取出烧瓶，关上炉门，令风扇继续运转十分钟以上驱除腔体内积存的水雾或其它气体，然后断电。
5．长期停用：节假日之前，务必对微波化学反应器作彻底清理，拆除所有玻璃件，腔体内擦净拭干后通电令风机工作十分钟以上，断电后将截止波导顶部小盖拧上，腔体内放置硅胶除湿，关上炉门。