光谱分析仪器和化学分析仪器在冶金、化学、制药、机械、新材料开发、航空、宇宙探索等很多领域都有着很广泛的应用。两者之间又有着各自的优点和不足。
　　光谱分析仪的优点：
　　采样方式灵活，对于稀有和贵重金属的检测和分析可以节约取样带来的损；测试速率高，可设定多通道瞬间多点采集，并通过计算器实时输出；对于一些机械零件可以做到无损检测，而不破坏样品，便于进行无损检测；分析速度较快，比较适用做炉前分析或现场分析，从而达到快速检测；分析结果的准确性是建立在化学分析标样的基础上。
　　化学分析仪的优点：
　　化学分析法是国家实验室所使用的仲裁分析方法，准确度高；对于各元素之间的干扰可以用化学试剂屏蔽，做到元素之间互不干扰，曲线可进行非线性回归，确保了检测的准确性；取样过程是深入样品中心和多点采集，更具有代表性，特别是对于不均匀性样品和表面处理后的样品可准确检测；应用领域广泛，局限性小，可建立标准曲线进行测定，钢铁材料元素化验分析仪仪器可进行曲线自我检测；购买和维护成本低，维护比较简单。
　　光谱分析仪的缺点：
　　1、对于非金属和界于金属和非金属之间的元素很难做到准确检测。
　　2、不是原始方法，不能作为仲裁分析方法，检测结果不能做为国家认证依据。?
　　3、受各企业产品相对垄断的因素，购买和维护成本都比较高，性价比较低。?
　　4、需要大量代表性样品进行化学分析建模，对于小批量样品检测显然不切实际。?
　　5、模型需要不断更新，在仪器发生变化或者标准样品发生变化时，模型也要变化。
　　6、建模成本很高，测试成本也就比较大了，高速碳硫分析仪当然对于大量样品检测时，测试成本会下降。
　　7、易受光学系统参数等外部或内部因素影响，经常出现曲线非线性问题，对检测结果的准确度影响较大。
　　化学分析仪的缺点：
　　1、流程比光谱分析法较多，工作量较大。
　　2、不适用于炉前快速分析。
　　3、对于检测样品会因为取样过程遭到破坏。