光合作用是地球上最重要的生命现象，它是能把太阳能转化为稳定的化学能贮藏在有机物中的过程，是维持地球上物质循环的关键环节，也是农作物产量形成的决定性因素。因此，提高光合作用对于提高作物产量具有十分重要的意义。光合作用一直是科学家研究的热点。光合仪作为的测定光合速率的仪器之一，在农学，生理，园艺，林学等多个领域已经得到广泛应用。
　　光合荧光仪在应用中的缺点：
　　1、光合仪和荧光仪结合在一起大大限制了荧光仪的使用，操作相对复杂，必须对荧光理论非常熟悉才能测定准确的数据。
　　2、荧光参数分为暗适应下和光适应下的参数，光合荧光仪对于光适应下的荧光参数测定非常准确，快捷，但对于暗适应下的参数测定相对复杂，且容易受到叶面积的限制;单独用荧光仪测定时不受叶面积的影响，对于光下参数和暗适应后的参数都能很好的测定。
　　3、在一定程度上造成了资源的浪费。如果是两个仪器可以供两个分别使用光合仪和荧光仪的研究人员使用，整合在一起的光合荧光仪在使用光合功能时，别人不能应用其荧光功能。