在液相色谱仪分析中，根据流动相和固定相相对极性的不同，可分为正相色谱和反相色谱。所谓正相色谱是指固定相极性大于流动相极性的情况，反之，固定相的极性小于流动相的极性，则称为反相色谱。

　　正相分析的场合：

　　假设使用的溶剂是15%二氯甲烷/己烷混合溶液，样品在二氯甲烷中更易溶解。如果样品可以在流动相中完全溶解自然没有问题。

　　如果样品不能溶解在溶剂中，选择100%二氯甲烷作为溶剂的情况下可能会产生故障。

　　在一般情况下，经常使用混合溶剂作为流动相。哪种组合最易于样品溶解可以从样品的洗脱时间上看出。在选择溶解样品的溶剂之前，把流动相的组成在5~10%变化范围内各种样品的洗脱时间作比较，选择样品最容易溶解的溶剂。因为，样品和溶剂、流动相互相溶解是分析的前提条件。

　　反相分析的场合：

　　假设使用的溶剂是50%的乙腈，使用的样品在乙腈中比在水中更易溶解。当然，的方法是使样品完全溶解于流动相中。

　　然而，如果样品不能溶解在流动相中，如何选择溶剂呢？100%的乙腈溶液？或者浓度50%以下的乙腈水溶液？这种情况下，个选择就是浓度50%以下的乙腈水溶液。第二个选择就是100%的水溶液，可以100~500微升注入。最差的选择是100%乙腈溶液。因为即使样品完全溶解在了100%的乙腈溶液中，随着流动相的加入，可能乙腈溶液被稀释导致样品析出。轻则造成上述a,b两种故障，重则向c,d发展。最严重则发生f的故障，那就只能更换色谱柱了。

　　然而，混合样品的情况下可能发生g的故障。判断样品会不会在色谱柱内部析出可以通过以下步骤。减少样品较易溶解的，溶剂量，然后试着增加注入量。也就是说，如果是要求注入在100%乙腈溶液中溶解的样品20ul，可以试着注入在20%乙腈中溶解的样品125ul。如果上述的故障消失了，则说明使用100%乙腈作为溶剂是不合适的，样品会在色谱柱内析出。